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應(yīng)用案例
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天木生物ARTP和MMC成功助力葉綠素缺陷型小球藻的選育

來(lái)源:   作者: 發(fā)布日期:2024-05-20 訪問(wèn)量:1621

      本期為您推薦華南理工大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院魏東教授團(tuán)隊(duì)發(fā)表在國(guó)際藻類學(xué)期刊《Algal Research》上的一篇文章:Rapid screening of high-protein Auxenochlorella pyrenoidosa mutant by an integrated system of atmospheric and room temperature plasma mutagenesis and high-throughput microbial microdroplet culture。本研究利用常壓室溫等離子體誘變(ARTP)和高通量微生物微滴培養(yǎng)的集成系統(tǒng)(MMC),快速篩選出高蛋白質(zhì)的蛋白核小球藻突變株,為異養(yǎng)發(fā)酵生產(chǎn)替代蛋白質(zhì)提供了有希望的候選菌。

圖片

圖1 蛋白核小球藻高蛋白突變株的選育流程

       

       隨著全球人口的增長(zhǎng),對(duì)食物的需求也在增加,這加劇了在耕地減少和對(duì)傳統(tǒng)肉類生產(chǎn)的倫理?yè)?dān)憂中尋找新蛋白質(zhì)來(lái)源的需求。微藻作為一種有前途的替代蛋白質(zhì)來(lái)源,富含蛋白質(zhì)、氨基酸、多不飽和脂肪酸(PUFAs)、維生素和礦物質(zhì)。然而,在異養(yǎng)培養(yǎng)條件下,由于光合作用依賴的蛋白質(zhì)合成減少,微藻通常表現(xiàn)出較低的蛋白質(zhì)含量(<40% 干重),限制了其作為替代蛋白質(zhì)來(lái)源的潛力。為了克服這些挑戰(zhàn),開(kāi)發(fā)具有天然高蛋白質(zhì)含量的新型微藻菌株對(duì)于通過(guò)異養(yǎng)發(fā)酵高效大規(guī)模生產(chǎn)蛋白質(zhì)至關(guān)重要。

       研究人員前期利用ARTP誘變獲得金黃色蛋白核小球藻A4-1為出發(fā)藻株,進(jìn)行新一輪的ARTP誘變,輻照15秒后,轉(zhuǎn)移至搖瓶培養(yǎng)。將處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞稀釋至OD450nm值為0.6-0.8,轉(zhuǎn)移至MMC系統(tǒng)進(jìn)行進(jìn)一步培養(yǎng)。

       在MMC體系中,初始生成50個(gè)液滴,每一代運(yùn)行時(shí)間在24-46小時(shí),實(shí)時(shí)檢測(cè)液滴在450 nm處的吸光值,表征藻株生長(zhǎng)情況。經(jīng)過(guò)三輪培養(yǎng),篩選出長(zhǎng)勢(shì)好的液滴(第28號(hào)液滴)。整個(gè)實(shí)驗(yàn)流程僅耗時(shí)116小時(shí),相較于傳統(tǒng)平板體系有著較大的提升(圖 2A)。將液滴進(jìn)行單克隆分選,得到23株菌,選取其中4株(MMC-1、7、8和11)生長(zhǎng)速率或者生物量濃度較高的進(jìn)行后續(xù)的分析(圖 2B)。


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圖2 MMC中液滴的生長(zhǎng)和單克隆微孔板培養(yǎng)的細(xì)胞生長(zhǎng)


       在250 mL搖瓶中培養(yǎng)的四個(gè)選定突變體(MMC-1、7、8、11)的細(xì)胞生長(zhǎng)和生物量產(chǎn)量如圖 3A所示。所有突變體的生長(zhǎng)模式與A4-1藻株相似,均經(jīng)歷了初始滯后期,隨后迅速進(jìn)入指數(shù)生長(zhǎng)期。MMC-7達(dá)到了最高的生物量濃度8.21 g/L,比A4-1菌株的7.57 g/L高出8.49%(p < 0.05)。同時(shí)所有四個(gè)突變體在視覺(jué)上都呈現(xiàn)出與A4-1藻株相似的金黃色,未檢出葉綠素b,葉綠素a僅占野生型(WT)的1%(圖 3B)。


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圖3 突變株與出發(fā)藻株A4-1在搖瓶中的細(xì)胞生長(zhǎng)和色素組成

       

       生化成分分析顯示,在四個(gè)突變體中,蛋白質(zhì)含量增加了12%至40%(圖 4)。MMC-8突變體顯示出了最高的蛋白質(zhì)含量(63.26%干重)和低的淀粉含量(8.59%干重),比出發(fā)藻株A4-1分別增加了40.11%和減少了56.24%。此外,MMC-8在蛋白質(zhì)質(zhì)量上也表現(xiàn)出色,其氨基酸含量(44.35%干重)和評(píng)分(95)均高于A4-1。


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圖4 突變株與出發(fā)藻株A4-1生化組成


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圖5 系列突變株與出發(fā)藻株A4-1必需氨基酸指數(shù)與氨基酸組成


       本研究展示了ARTP-MMC系統(tǒng)作為一種強(qiáng)大的高通量篩選平臺(tái)的潛力,不僅提高了蛋白質(zhì)的合成效率,還減少了淀粉含量,使得碳分配向蛋白質(zhì)合成方向傾斜,對(duì)于提高生物蛋白質(zhì)生產(chǎn)效率和可持續(xù)性具有重要意義。


論文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.algal.2024.103509

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圖1 蛋白核小球藻高蛋白突變株的選育流程

       

       隨著全球人口的增長(zhǎng),對(duì)食物的需求也在增加,這加劇了在耕地減少和對(duì)傳統(tǒng)肉類生產(chǎn)的倫理?yè)?dān)憂中尋找新蛋白質(zhì)來(lái)源的需求。微藻作為一種有前途的替代蛋白質(zhì)來(lái)源,富含蛋白質(zhì)、氨基酸、多不飽和脂肪酸(PUFAs)、維生素和礦物質(zhì)。然而,在異養(yǎng)培養(yǎng)條件下,由于光合作用依賴的蛋白質(zhì)合成減少,微藻通常表現(xiàn)出較低的蛋白質(zhì)含量(<40% 干重),限制了其作為替代蛋白質(zhì)來(lái)源的潛力。為了克服這些挑戰(zhàn),開(kāi)發(fā)具有天然高蛋白質(zhì)含量的新型微藻菌株對(duì)于通過(guò)異養(yǎng)發(fā)酵高效大規(guī)模生產(chǎn)蛋白質(zhì)至關(guān)重要。

       研究人員前期利用ARTP誘變獲得金黃色蛋白核小球藻A4-1為出發(fā)藻株,進(jìn)行新一輪的ARTP誘變,輻照15秒后,轉(zhuǎn)移至搖瓶培養(yǎng)。將處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞稀釋至OD450nm值為0.6-0.8,轉(zhuǎn)移至MMC系統(tǒng)進(jìn)行進(jìn)一步培養(yǎng)。

       在MMC體系中,初始生成50個(gè)液滴,每一代運(yùn)行時(shí)間在24-46小時(shí),實(shí)時(shí)檢測(cè)液滴在450 nm處的吸光值,表征藻株生長(zhǎng)情況。經(jīng)過(guò)三輪培養(yǎng),篩選出長(zhǎng)勢(shì)好的液滴(第28號(hào)液滴)。整個(gè)實(shí)驗(yàn)流程僅耗時(shí)116小時(shí),相較于傳統(tǒng)平板體系有著較大的提升(圖 2A)。將液滴進(jìn)行單克隆分選,得到23株菌,選取其中4株(MMC-1、7、8和11)生長(zhǎng)速率或者生物量濃度較高的進(jìn)行后續(xù)的分析(圖 2B)。


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圖2 MMC中液滴的生長(zhǎng)和單克隆微孔板培養(yǎng)的細(xì)胞生長(zhǎng)


       在250 mL搖瓶中培養(yǎng)的四個(gè)選定突變體(MMC-1、7、8、11)的細(xì)胞生長(zhǎng)和生物量產(chǎn)量如圖 3A所示。所有突變體的生長(zhǎng)模式與A4-1藻株相似,均經(jīng)歷了初始滯后期,隨后迅速進(jìn)入指數(shù)生長(zhǎng)期。MMC-7達(dá)到了最高的生物量濃度8.21 g/L,比A4-1菌株的7.57 g/L高出8.49%(p < 0.05)。同時(shí)所有四個(gè)突變體在視覺(jué)上都呈現(xiàn)出與A4-1藻株相似的金黃色,未檢出葉綠素b,葉綠素a僅占野生型(WT)的1%(圖 3B)。


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圖3 突變株與出發(fā)藻株A4-1在搖瓶中的細(xì)胞生長(zhǎng)和色素組成

       

       生化成分分析顯示,在四個(gè)突變體中,蛋白質(zhì)含量增加了12%至40%(圖 4)。MMC-8突變體顯示出了最高的蛋白質(zhì)含量(63.26%干重)和低的淀粉含量(8.59%干重),比出發(fā)藻株A4-1分別增加了40.11%和減少了56.24%。此外,MMC-8在蛋白質(zhì)質(zhì)量上也表現(xiàn)出色,其氨基酸含量(44.35%干重)和評(píng)分(95)均高于A4-1。


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圖4 突變株與出發(fā)藻株A4-1生化組成


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圖5 系列突變株與出發(fā)藻株A4-1必需氨基酸指數(shù)與氨基酸組成


       本研究展示了ARTP-MMC系統(tǒng)作為一種強(qiáng)大的高通量篩選平臺(tái)的潛力,不僅提高了蛋白質(zhì)的合成效率,還減少了淀粉含量,使得碳分配向蛋白質(zhì)合成方向傾斜,對(duì)于提高生物蛋白質(zhì)生產(chǎn)效率和可持續(xù)性具有重要意義。


論文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.algal.2024.103509
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